Creo que esta es realmente una buena pregunta, y me inclino hacia que posiblemente sea a donde la investigación finalmente conduzca. El estudio que menciona el OP aquí encontró que prácticamente todos los lobos en América del Norte tienen algún nivel de ascendencia de coyote, incluidos los de Alaska y Yellowstone, donde los lobos se comportan antagónicamente hacia los coyotes. Hay diminutas subespecies de Canis lupus en el Viejo Mundo. El lobo Honshu era del tamaño de un golden retriever, y el lobo árabe ahora tiene aproximadamente el tamaño de los coyotes orientales.
El análisis de la secuencia del genoma completo muestra que dos especies endémicas de lobo norteamericano son mezclas del coyote y el lobo gris.
Un estudio de comparación del genoma similar realizado por Fan et al en 2015 encontró que aproximadamente una cuarta parte de todos los lobos en el Viejo Mundo tenían alguna ascendencia de perros domésticos, e incluso antes de que saliera ese estudio, hubo un fuerte movimiento para mover a los perros domésticos a una subespecie de lobo. Si nos adherimos a las reglas cladísticas apropiadas para la clasificación, en las cuales los taxones incluyen a todos los descendientes de un antepasado común, entonces los perros deben clasificarse como Canis lupus familiaris.
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Patrones mundiales de variación genómica y mezcla en lobos grises
El estudio al que se hace referencia en la pregunta OP plantea de hecho exactamente la misma pregunta para los coyotes. Se está haciendo mucho ruido sobre lo que dijo sobre los lobos rojos y los lobos orientales, pero ese ruido es problemático cuando uno se da cuenta de que los coyotes no son tan diferentes de los lobos y en realidad podrían clasificarse como una subespecie de lobo.
Es muy posible que los coyotes se deriven de un linaje de lobos euroasiáticos que deambularon por América del Norte hace unos 50,000 años. En ese momento, un gran nicho de lobos cazadores de manadas ya estaba ocupado por varias formas de lobo endémico de América del Norte. Había osos masivos que eran excelentes cazadores y orgullosos de leones masivos. Probablemente no había espacio en el ecosistema para otro cánido grande de caza de manadas, por lo que estos primeros invasores de lobos comenzaron a adaptarse a un estilo de vida más chacal y al tamaño del cuerpo. Algo bastante similar sucedió cuando los lobos invadieron África, que tiene un gran gremio de depredadores similar a la antigua América del Norte. Los llamados “chacales dorados” de África han resultado ser muy cercanos a los lobos, mucho más que al chacal dorado de Eurasia. Lo que estos “lobos dorados” son exactamente todavía se está debatiendo en la literatura, pero muestra que tal vez los lobos pueden evolucionar en características de chacales paralelos cuando tienen que hacerlo.
La evidencia de todo el genoma revela que los chacales dorados africanos y euroasiáticos son especies distintas
La división entre coyotes y lobos es una medida importante que se utiliza para calibrar cuando las diferentes formas de Canis divergen entre sí. Se suponía que los coyotes se separaron de los lobos hace aproximadamente un millón de años, según el registro fósil, pero esta división más reciente reveló que esos fósiles “coyote” eran de cánidos cuyo linaje se extinguió. Con esta fecha más reciente, se pone en duda una suposición principal de los modelos utilizados para determinar cuándo estos linajes divergieron. Agregue la interfertilidad que existe entre el complejo de chacal dorado lobo-perro-coyote-africano y las especies de chacal dorado eurasiático y lobo etíope, se vuelve muy turbio.