Depende de la temporada: las tortugas de caja dormirán en madrigueras, debajo de arbustos o en montones de hojas secas. Richard A. Dolbeer detalló sus observaciones sobre el comportamiento de hibernación de las tortugas de caja en el este de Tennessee: durante el otoño, las tortugas de caja siempre están enterradas en la hojarasca, presumiblemente dormidas, cuando no están activas. Las tortugas de caja a menudo estaban enterradas lo suficientemente profundo como para que la parte superior de sus caparazones estuviera al ras del suelo.
En el estudio de Dolbeer, descubrió que las tortugas de caja preferían madrigueras profundas y agujeros para dormir durante el invierno. La mayoría de las veces, usaban agujeros de tocones en descomposición, pero algunas especies cavaron sus propias madrigueras. Cuando no hay una madriguera o un agujero disponible, una tortuga podría arrastrarse profundamente en la densa vegetación para dormir. Las tortugas de caja del este a veces usan enredos de mora como lugar para dormir. Las espinas afiladas de los arbustos alejan a algunos depredadores, y la mora sirve como un alimento básico importante para las tortugas.
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